軍方搜救高雄縣甲仙鄉與那瑪夏鄉失聯居民11日晚間傳出重大進展，國防部表示，特戰部隊官兵晚間以衛星電話通報，在甲仙鄉小林村入口處約1公里的地方，發現避難村民約200人，已先供給飲水與糧食；另外，在那瑪夏鄉的民族村找到避難中的村民200餘人，民生村找到約300人，總計發現約700名待援村民。

八八水在重創南台灣，其中高雄縣甲仙鄉小林村、那瑪夏鄉民族村等5村災情慘重，稍早並傳出有大批村民恐遭活埋，不過陸軍航空特戰指揮部及陸戰隊隊員11日上午共73名隊員，分成2梯次以UH-1H直升機載運，空降小林村平台、那瑪夏鄉民族村、桃源鄉勤和村等處，並後送24人，但未接獲受困災民回報有大批村民遭活埋情況。

原本中央災害應變中心在11日稍早表示，國軍特種部挺進災區後，目前甲仙鄉小林村和那瑪夏鄉民族村等5村的災情，已經全部明朗，從最上游那瑪夏鄉民生村到下游的甲仙鄉小林村1鄰災情，中央災害應變中心都已掌握。

不過，高雄縣長楊秋興11日晚上8時30分主持莫拉克颱風勤指中心會報時則表示，桃源鄉狀況不明，仍有很多地區災情嚴重；至於外界指稱六龜鄉新發村發現30多具屍體，楊秋興說，目前尚無法證實。

高雄縣11日累計出動直昇機102架次，救出450人，累積死亡27人，而高雄縣勤指中心於晚間8時30分再度接獲桃源鄉梅山村堰塞湖潰堤的壞消息，桃源消防分隊撤離，同步發布要荖濃溪沿線民眾緊急撤離的消息，以免山洪爆發讓災情惡化。